現行的環保設施運營模式有兩種：一是排污企業建設的污染防治設施是由該企業負責運行管理；二是公共性的污染防治設施如城市生活廢水和生活垃圾處理設施是由公益性的事業單位進行管理。

這兩種模式都存在著不利于污染防治設施正常運行的種種弊端：其一，工業企業污染防治設施的運行費用由企業負擔，公共性的污染防治設施運行的費用由政府負擔，無論對企業還是對政府這都是一個沉重的包袱。其二，污染防治設施的運行沒有引入企業運行模式，對設施運行管理的單位或個人來說，不進行成本效益核算，沒有明顯的經濟效益，因此，難以有積極性來保障污染防治設施的正常運行。其三，對污染防治設施運行管理的個人或單位，目前沒有進行資質方面的認可管理，相當一部分的單位和個人業務素質很差，不具備污染防治設施運行管理的能力，不可能保障污染防治設施的正常運行。